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Bienvenue sur la collection MicroScope, vous y trouverez les publications scientifiques qui ont utilisé la plate-forme MicroScope

MicroScope membre des infrastructures IFB et France Génomique est la plate-forme d'annotation et d'analyse du génome microbien du LABGeM - CEA/Genoscope sous la tutelle CEA, CNRS et Université Evry Val de Seine

Les différentes activités de la plate-forme MicroScope sont : L'innovation de génomes microbiens (génomes et métagénomes assemblés) et développement d'outils destinés à l'annotation, à la génomique et au métabolisme comparatifs de génomes bactériens; la génomique comparative et pangénomique; la prédiction de fonction et de processus biologiques; la reconstruction de réseaux métaboliques; l'analyse de données de transcriptonique; l'assistance techniques; la formation à l'annotation de génomes procaryotes et à la curation de réseaux métaboliques.

COLLABORATION INTERNATIONALE

 

 Pour toute question : hal@cea.fr

 

NOMBRE DE TEXTES INTEGRAUX

222

NOMBRE DE NOTICES

72

INDICATEUR D'OPEN ACCESS

87 %

MOTS CLES

Brochothrix thermosphacta Comparative genomics Evolution Flavobacterium psychrophilum Biodiversity Pangenome Nitrification Bacteria Microbiology Alkaline thermal spring Food Genomics Holobiont Natural products Fish-pathogenic bacteria Fish pathogen Metagenomics Lactic acid bacteria Horizontal gene transfer Transcriptomics Acid mine drainage AMD Bacterial Actinorhizal symbiosis Archaea Escherichia coli Microbial genomics Agrobacterium tumefaciens DDDH Bactérie ACL Insect Marine bacteria Virulence Acinetobacter baumannii Gene regulation Genome sequence Phylogeny Iron uptake Experimental evolution Metabolomics Coevolution Genome evolution Genome-scale metabolic networks Activated sludge Betaproteobacteria Rhizobium Transcriptome Aquaculture Magnetotaxis Hydrothermal Anaerobic Metabolic networks HGT Nitrogen fixing Complete genome Mobile genetic elements Digital DNA-DNA hybridization Directed evolution Magnetotactic bacteria Gut microbiota Polyphasic taxonomy Bacteroidetes Functional annotation Fitness cost Dehalogenation Pathogenicity Proteomics Average nucleotide identity Genome mining Virulence factors Metabolism Clostridioides difficile Bacteriophage Fish pathogens Continuous culture Legume-rhizobium symbiosis CTX-M-15 ESBL Formate assimilation Biofilm Lactobacillus Arsenic Bioremediation Heavy metal resistance Genomes Thermophile Molecular evolution Flavobacteriaceae Mineral weathering Dichloromethane Nitrogen fixation Functional genomics Cyanobacteria Genome Bacteriocin Adaptation Secondary metabolites Oxidative stress Symbiosis Bacterial genetics